CD7 CAR T细胞的生成与药物处理
评估依鲁替尼和达沙替尼是否能有效防止CD7 CAR T细胞的自相残杀并支持扩增
从健康供者PBMCs制备CD7 CAR T细胞,在转导前后加入依鲁替尼和达沙替尼,扩增并检测CAR表达、CD7表达、细胞活力和扩增倍数。
Feasibility and preclinical efficacy of CD7-unedited CD7 CAR T cells for T cell malignancies
包括体外细胞系共培养、NSG小鼠异种移植模型、患者样本cGMP生产验证及RNA-seq转录组分析等多层级验证,且包含功能验证和机制研究。
Jurkat T-ALL细胞系 CCRF-CEM T-ALL细胞系 NSG小鼠异种移植模型 患者来源的PBMCs
依鲁替尼和达沙替尼的浓度(200 nM,临床生产为500 nM) CD7 CAR T细胞的制造流程(包括转导和扩增时间) 效应细胞与靶细胞的比例(1:4和1:10) PI CAR T细胞撤除抑制剂后的细胞毒性恢复时间(4小时) 体内实验中T细胞输注剂量(2×10^6或3×10^6 CAR+细胞)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估依鲁替尼和达沙替尼是否能有效防止CD7 CAR T细胞的自相残杀并支持扩增
从健康供者PBMCs制备CD7 CAR T细胞,在转导前后加入依鲁替尼和达沙替尼,扩增并检测CAR表达、CD7表达、细胞活力和扩增倍数。
验证撤除依鲁替尼和达沙替尼后PI CAR T细胞是否恢复抗肿瘤细胞毒性
将撤除抑制剂的PI CAR T细胞与Jurkat或CCRF-CEM靶细胞共培养,检测细胞毒性、细胞因子产生和T细胞扩增。
评估PI CAR T细胞在异种移植模型中的抗白血病活性和持续性
向NSG小鼠或NSG-MHC I/II DKO小鼠注射表达荧光素酶的Jurkat或CCRF-CEM细胞,随后输注PI CAR T细胞或对照CAR T细胞,监测肿瘤负荷和T细胞持续。
确定存留的CD7− PI CAR T细胞的表型、CD7表达缺失机制及其与CD7编辑CAR T细胞的转录组相似性
从外周血和脾脏中分离存留的T细胞,通过流式检测CD7表达,Western blot和qPCR检测蛋白和mRNA,并进行RNA-seq比较转录组。
验证能否在cGMP条件下为患者生产功能性未编辑CD7 CAR T细胞
从T-ALL患者PBMCs制备CD7 CAR T细胞,在cGMP设施中扩增,评估细胞扩增、活力、CAR表达、载体拷贝数、细胞毒性及残存肿瘤细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| CAR T细胞生成 | 依鲁替尼 | Selleckchem | S2680 |
| 达沙替尼 | Selleckchem | S1021 | |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco BRL Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Gibco BRL Life Technologies | -- | |
| l-谷氨酰胺补充剂 | Gibco BRL Life Technologies | -- | |
| 白细胞介素-7 | -- | -- | |
| 白细胞介素-15 | -- | -- | |
| CAR T细胞生成 | OKT3抗体 | Ortho Biotech | -- |
| 抗CD28抗体 | BD Biosciences | -- | |
| Retronectin重组人纤连蛋白片段 | TAKARA BIO | -- | |
| 流式细胞术 | Gallios流式细胞仪 | Beckman Coulter Life Sciences | -- |
| FACSCanto流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Kaluza流式分析软件 | Beckman Coulter Life Sciences | -- | |
| FlowJo软件 | BD Biosciences | -- | |
| CountBright绝对计数微球 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 7-AAD | BD Biosciences | -- | |
| 可固定活力染料700 | BD Biosciences | -- | |
| BD Cytofix/Cytoperm固定破膜液 | BD Biosciences | -- | |
| 红细胞裂解液 | BioLegend | -- | |
| Western blot | Mini-PROTEAN Tetra电泳槽 | Bio-Rad | -- |
| 抗CD7抗体 | Abcam | ab109296 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-32233 | |
| 山羊抗小鼠IRDye 680RD二抗 | LI-COR Biosciences | 925-68070 | |
| 山羊抗兔IRDye 800CW二抗 | LI-COR Biosciences | 925-32211 | |
| LI-COR Odyssey CLx成像系统 | LI-COR Biosciences | -- | |
| qPCR | RNeasy RNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| Superscript III逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| iTaq Universal SYBR Green预混液 | Bio-Rad | -- | |
| CFX85实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| RNA-seq | Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| 体内成像 | D-荧光素 | PerkinElmer | -- |
| IVIS Lumina II成像系统 | Caliper Life Sciences | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 7软件 | GraphPad Software | -- |
| 细胞因子检测 | 莫能霉素 | BD Biosciences | -- |
| 流式细胞术 | 抗Fc抗体 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| CAR T细胞生成 | 依鲁替尼浓度200 nM,达沙替尼浓度200 nM(临床生产为500 nM);转导时间第5天;IL-7和IL-15浓度10 ng/mL 阅读提示:Materials and methods: Generation of CAR-modified T cells |
| 体外功能验证 | 效应细胞与靶细胞比例1:4和1:10;共培养时间72小时;撤除抑制剂后恢复时间(4小时) 阅读提示:Figure 1 legends |
| 体内动物实验 | NSG或NSG-MHC I/II DKO小鼠;肿瘤细胞注射剂量(Jurkat 1×10^6,CCRF-CEM 0.5×10^6);T细胞输注剂量(2×10^6或3×10^6 CAR+);输注时间(肿瘤接种后3天) 阅读提示:Materials and methods: In vivo models 及 Figure 2 legends |
| cGMP生产 | 依鲁替尼200 nM,达沙替尼500 nM;IL-7和IL-15浓度5 ng/mL;扩增时间4天 阅读提示:Materials and methods: cGMP manufacturing |
| 转录组分析 | RNA-seq平台(Illumina NovaSeq 6000),比对参数(STAR),DEG标准(|log2FC|≥1, FDR≤0.05) 阅读提示:Materials and methods: RNA-seq and data analysis |