scFv抗体筛选与鉴定
从人scFv噬菌体展示文库中筛选特异性识别MAGE-A4 pMHC的抗体,并验证其结合特异性和亲和力。
使用MAGE-A4 pMHC为靶标进行三轮筛选,通过ELISA和表面等离子体共振分析鉴定出scFv #17,并通过丙氨酸扫描和类似肽结合实验评估其特异性。
Preclinical evaluation of a novel CAR-T therapy utilizing a scFv antibody highly specific to MAGE-A4p230-239/HLA-A∗02:01 complex
包含scFv筛选与亲和力测定、体外细胞功能实验、动物模型体内疗效评估以及交叉反应性综合分析等多个独立证据层级,并明确进行了功能验证和机制验证。
MAGE-A4+/HLA-A∗02:01+黑色素瘤细胞系(NW-MEL-38、SK-MEL-37、A375) MAGE-A4+/HLA-A∗02:01+骨髓瘤细胞系U266 MAGE-A4+/HLA-A∗02:01+肉瘤细胞系LB23 NOG免疫缺陷小鼠异种移植模型
scFv #17对MAGE-A4 pMHC的亲和力(KD值22 nM) MAGE CAR-T细胞对MAGE-A4+ HLA-A∗02:01+肿瘤细胞系的特异性杀伤作用 GITR ICD与CD28或4-1BB ICD在体内的抗肿瘤功效比较 MAGE CAR-T细胞对类似肽缺乏交叉反应性
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从人scFv噬菌体展示文库中筛选特异性识别MAGE-A4 pMHC的抗体,并验证其结合特异性和亲和力。
使用MAGE-A4 pMHC为靶标进行三轮筛选,通过ELISA和表面等离子体共振分析鉴定出scFv #17,并通过丙氨酸扫描和类似肽结合实验评估其特异性。
评估表达scFv #17 CAR的T细胞能否特异性识别内源性MAGE-A4肽并发挥抗肿瘤功能。
构建编码CAR(含GITR ICD)的逆转录病毒载体,转导人T细胞,通过IFN-γ ELISA和细胞毒性实验检测CAR-T细胞对多种肿瘤细胞系的反应性。
比较不同ICD(GITR、CD28、4-1BB)的CAR-T细胞在NOG小鼠模型中的抗肿瘤效果。
在NOG小鼠双侧皮下移植NW-MEL-38和HCT116细胞,4天后静脉注射CAR-T细胞,监测肿瘤生长并评估肿瘤组织中的T细胞浸润。
评估MAGE CAR-T细胞对类似肽的交叉反应性,预测潜在脱靶毒性。
通过IFN-γ ELISPOT和HLA稳定实验,检测CD8+ CAR-T细胞对一系列丙氨酸替代肽和来自人类蛋白质组的潜在风险肽的反应性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | WAKO | -- |
| 胎牛血清 | Biowest | -- | |
| 肽合成 | 多肽 | Invitrogen | -- |
| scFv筛选 | 链霉亲和素 | Pierce | -- |
| Dynabeads MyOne磁珠 | Invitrogen | -- | |
| 磁力架 | TOYOBO | -- | |
| XL1-Blue大肠杆菌 | Invitrogen | -- | |
| VCSM辅助噬菌体 | -- | -- | |
| 抗cp3单克隆抗体 | MBL | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的抗小鼠IgG | MBL | -- | |
| TMB底物溶液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Spectramax M2酶标仪 | Molecular Devices | -- | |
| SPR分析 | Biacore 3000系统 | GE Healthcare | -- |
| CAP传感芯片 | GE Healthcare | -- | |
| scFv纯化 | Ni Sepharose Excel树脂 | GE Healthcare | -- |
| Complete蛋白酶抑制剂 | Roche | -- | |
| scFv结合实验 | 抗DDDDK小鼠单克隆抗体 | -- | -- |
| Alexa Fluor 488标记的山羊抗小鼠多克隆抗体 | Invitrogen | -- | |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 肽结合实验 | X-Vivo15培养基 | Lonza | -- |
| Alexa Fluor 488标记的抗HLA-A2单克隆抗体(BB7.2) | Bio-Rad | -- | |
| 载体构建 | pMS3逆转录病毒载体 | Takara Bio | -- |
| TransIT-293转染试剂 | Mirus Bio | -- | |
| G3T-hi细胞 | Takara Bio | -- | |
| PG13细胞 | ATCC | -- | |
| pMHC复合物合成 | Superdex 200 10/300 GL凝胶过滤柱 | GE Healthcare | -- |
| Bulk BirA生物素化试剂 | AVIDITY | -- | |
| 链霉亲和素-藻红蛋白 | PROzyme | -- | |
| T细胞转导 | 抗CD3抗体(OKT3) | Janssen Pharmaceutica | -- |
| RetroNectin重组人纤连蛋白片段 | Takara Bio | -- | |
| GT-T551培养基 | Takara Bio | -- | |
| 人重组IL-2 | Novartis | -- | |
| 人血清白蛋白 | CLC Behring | -- | |
| 流式分选 | 抗CD4 APC抗体(RPA-T4) | BioLegend | -- |
| 抗CD8 APC-Cy7抗体(RPA-T8) | BioLegend | -- | |
| FACS Aria流式细胞仪 | BD Bioscience | -- | |
| 抗λ轻链抗体(MHL-38) | BioLegend | -- | |
| 体外功能实验 | 铬-51 | -- | -- |
| Triton X-100去污剂 | -- | -- | |
| 非放射性细胞毒性检测系统 | Techno Suzuta | -- | |
| TriStar2 LB942多功能酶标仪 | Berthold Technologies | -- | |
| 动物实验 | NOG小鼠 | Central Institute for Experimental Animals | -- |
| ELISPOT实验 | ELISPOT板(MAHA S4510) | Millipore | -- |
| 抗人IFN-γ单克隆抗体(1-D1K) | Ptech | -- | |
| 生物素化捕获抗体(7-B6-1) | Mabtech | -- | |
| 碱性磷酸酶偶联底物试剂盒 | Bio-Rad | -- | |
| ELISPOT读板仪 | CTL-Europe | -- | |
| 免疫荧光组织化学 | OCT包埋剂 | Sakura Finetech | -- |
| Blocking One Histo封闭液 | Nacalai Tesque | -- | |
| 异硫氰酸荧光素标记的抗CD8抗体(HIT8a) | BD Biosciences | -- | |
| 含DAPI的Prolong Gold抗淬灭封片剂 | Life Technologies | -- | |
| 荧光显微镜(BX53F) | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| scFv筛选与鉴定 | scFv噬菌体展示文库的来源和多样性(3.4×10^12 CFU);筛选时使用的竞争肽(CMV、Melan A、NY-ESO-1);MAGE-A4 pMHC的浓度和固定化方式。 阅读提示:材料与方法中的'Isolation of scFv reactive to the MAGE-A4p230-239/HLA-A∗02:01 complex'部分 |
| CAR-T细胞构建与转导 | 逆转录病毒载体(pMS3)中的CAR结构(scFv、铰链、跨膜、胞内信号域);转导方法(RetroNectin结合病毒)和细胞培养条件(IL-2浓度、培养基)。 阅读提示:材料与方法中的'Vector construction and preparation of virus solutions'和'T cell transduction'部分 |
| 体外功能实验 | 效应细胞(MAGE CAR-T)与靶细胞的比例和共培养时间;IFN-γ ELISA的检测时间和靶细胞类型;细胞毒性实验的检测系统和E:T比例。 阅读提示:材料与方法中的'In vitro functional assay'部分;Figure 2图注 |
| 动物实验 | NOG小鼠的品系、年龄和来源;肿瘤细胞接种数量(2.5×10^6)和途径(皮下);CAR-T细胞注射剂量(5×10^6)和途径(静脉);肿瘤生长监测频率(每周两次)。 阅读提示:材料与方法中的'In vivo antitumor activity'部分;Figure 3图注 |
| 交叉反应性评估 | T2细胞和肽浓度(10 μM);IFN-γ ELISPOT检测中使用的肽库(200种单氨基酸替代肽);HLA稳定实验的条件(肽孵育时间和浓度)。 阅读提示:材料与方法中的'ELISPOT assay'和'Peptide binding assay'部分;Figure 5图注 |