患者样本中PRMT1表达分析
检测cGVHD患者与无cGVHD患者免疫细胞中PRMT1表达差异。
从cGVHD患者和对照患者外周血中分离CD4+ T细胞、CD8+ T细胞和B细胞,通过RT-qPCR和Western blot检测PRMT1 mRNA和蛋白表达。
Targeting PRMT1 prevents acute and chronic graft-versus-host disease
包含患者样本分析、两个小鼠模型(硬化样和狼疮样cGVHD)、aGVHD模型、细胞功能实验及机制验证(Co-IP、质谱、突变体等),多层级验证充分。
硬化样cGVHD小鼠模型(C57BL/6→BALB/c) 狼疮样cGVHD小鼠模型(DBA/2→BALB/c) aGVHD小鼠模型(C57BL/6→BALB/c) cGVHD患者来源的CD4+ T细胞和B细胞
PRMT1在cGVHD患者和小鼠CD4+ T细胞和B细胞中的表达上调 PRMT1抑制剂TCE5003的预防性给药方案(1.5 mg/kg,每周尾静脉注射) Th17细胞、生发中心B细胞和浆细胞比例的变化 IDH2在精氨酸353位点的非对称二甲基化 PRMT1对IDH2二聚化和酶活性的影响
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测cGVHD患者与无cGVHD患者免疫细胞中PRMT1表达差异。
从cGVHD患者和对照患者外周血中分离CD4+ T细胞、CD8+ T细胞和B细胞,通过RT-qPCR和Western blot检测PRMT1 mRNA和蛋白表达。
验证cGVHD小鼠模型中PRMT1表达是否上调。
建立硬化样和狼疮样cGVHD小鼠模型,分离脾脏CD4+ T细胞、CD8+ T细胞和B细胞,检测PRMT1 mRNA表达。
评估抑制PRMT1是否减轻硬化样cGVHD、狼疮样cGVHD和aGVHD。
对GVHD小鼠预防性给予TCE5003或对照,监测生存率、体重、临床评分及组织病理学变化。
确定抑制PRMT1对T细胞和B细胞亚群的影响。
收集小鼠脾脏和患者外周血细胞,通过流式细胞术检测Th17、Th1、Th2、Treg、GC B细胞、浆细胞比例及B细胞增殖。
验证抑制PRMT1对cGVHD患者CD4+ T细胞和B细胞功能的影响。
分离患者CD4+ T细胞和B细胞,用TCE5003处理,检测Th17分化、B细胞增殖、CD138+细胞比例和IgG/IgM分泌。
探索PRMT1调节B细胞功能的分子机制。
通过质谱、Co-IP、定点突变、体外甲基化实验和交联实验,验证PRMT1对IDH2的甲基化及对二聚化的影响。
验证IDH2对B细胞增殖和抗体产生的作用。
在cGVHD患者B细胞中过表达或敲低IDH2,或用IDH2抑制剂处理,检测B细胞增殖、CD138+细胞比例和IgG产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞分离 | Ficoll-Paque Plus | Cytiva | -- |
| 细胞分选 | 磁珠 | STEMCELL Technologies | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| B细胞刺激 | 抗IgM抗体 | Jackson ImmunoResearch | -- |
| CD40配体 | Peprotech | -- | |
| 白细胞介素4 | Biolegend | -- | |
| B细胞增殖检测 | 羧基荧光素二乙酸琥珀酰亚胺酯 | BD Pharmingen | -- |
| T细胞培养 | 抗人CD3抗体(OKT3) | BioLegend | -- |
| 抗CD28抗体(CD28.2) | BioLegend | -- | |
| Th1极化 | 重组人IL-12 | BioLegend | -- |
| Th17极化 | 重组人IL-6 | BioLegend | -- |
| 重组人IL-23 | BioLegend | -- | |
| 重组人IL-21 | BioLegend | -- | |
| 重组人IL-1β | BioLegend | -- | |
| 重组人TGF-β1 | BioLegend | -- | |
| 抗人IFN-γ抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗人IL-2抗体 | BioLegend | -- | |
| Treg极化 | 重组人TGF-β1 | BioLegend | -- |
| 重组人IL-2 | BioLegend | -- | |
| 流式细胞术 | 可固定活力染料700 | BD Biosciences | -- |
| 白细胞激活混合物 | BD Pharmingen | -- | |
| 固定/透化溶液 | BD Biosciences | -- | |
| 透化/洗涤缓冲液 | BD Biosciences | -- | |
| 转录因子固定/透化缓冲液 | BD Biosciences | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| PRMT1抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| IDH2多克隆抗体 | Proteintech | -- | |
| β-微管蛋白抗体 | ABclonal | -- | |
| 非对称二甲基精氨酸基序抗体 | Cell Signaling Technology | -- | |
| 抗His抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗GFP抗体 | Proteintech | -- | |
| 流式抗体 | BV421-CD138抗体 | BioLegend | -- |
| PE-GL7抗体 | Bioscience | -- | |
| PerCP-CY5.5 I-A I-E抗体 | Bioscience | -- | |
| APC-CD95抗体 | BioLegend | -- | |
| FITC-H-2Kb抗体 | Bioscience | -- | |
| PE-CY7 CD86抗体 | BioLegend | -- | |
| APC-Cy7 B220抗体 | BD Bioscience | -- | |
| BV605 CD4抗体 | BD Bioscience | -- | |
| FITC-CD5.1抗体 | Bioscience | -- | |
| BV650 CD8抗体 | BioLegend | -- | |
| BV510-CD3e抗体 | BD Bioscience | -- | |
| Ki67-APC抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-CY7-IFN-γ抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-IL-17A抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-CY7-IL-17A抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-CY7 CD25抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-Foxp3抗体 | BD Pharmingen | -- | |
| FITC-CD4抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-CY7-IFN-γ抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-CY7-IL-17A抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-CY7 CD25抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-Foxp3抗体 | BD Pharmingen | -- | |
| FITC-B220抗体 | BioLegend | -- | |
| PE-CD138抗体 | BioLegend | -- | |
| 药物处理 | TCE-5003 | Selleck | -- |
| AGI-6780 | Selleck | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qPCR | HiScript II Q RT SuperMix逆转录试剂盒 | Vazyme | -- |
| HiScript II一步法实时定量PCR SYBR Green试剂盒 | Vazyme | -- | |
| Co-IP | Western/IP裂解液 | Solarbio | -- |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Thermo Fisher Science | -- | |
| BeyoMag抗Flag磁珠 | Beyotime | -- | |
| BeyoMag抗His磁珠 | Beyotime | -- | |
| BeyoMag抗GFP磁珠 | Beyotime | -- | |
| 质谱 | 质谱分析 | SpecAlly Life Technology Co., Ltd | -- |
| 细胞转染 | Opti-MEM培养基 | Gibco | -- |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Thermo Fisher Science | -- | |
| IDH2活性检测 | NADP+ | -- | -- |
| 酶标仪 | Bio-Rad | -- | |
| 尿液蛋白检测 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- |
| 抗dsDNA检测 | 抗dsDNA IgG ELISA试剂盒 | Sigma | -- |
| IgG/IgM检测 | ELISA试剂盒 | Bethyl Laboratories | -- |
| 去除CD25+细胞 | 生物素偶联抗CD25单克隆抗体和抗生物素微珠 | Miltenyi Biotec | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者样本采集与分选 | 患者纳入标准(NIH标准)、cGVHD诊断、样本数量(90例cGVHD、50例对照)、细胞分选纯度(>90%) 阅读提示:Materials and methods - Patient samples |
| 小鼠GVHD模型 | 小鼠品系、周龄、照射剂量(800 cGy)、细胞数量(BM与脾细胞数量)、TCE5003剂量(1.5 mg/kg)及给药方案(每周尾静脉注射) 阅读提示:Materials and methods - Mice, GVHD murine models |
| PRMT1表达检测 | 检测样本(CD4+ T、B细胞)、方法(RT-qPCR、Western blot)、抗体信息、内参基因 阅读提示:Materials and methods - Quantitative real-time PCR, Western blotting |
| 流式细胞术 | 抗体克隆号及荧光标记、刺激条件(Leukocyte Activation Cocktail)、固定透化步骤、分析软件 阅读提示:Materials and methods - Flow cytometry |
| 体外细胞培养与极化 | 细胞数量、刺激因子及浓度(如anti-IgM 20 μg/mL, CD40L 100 ng/mL, IL-4 10 ng/mL)、极化条件(Th1、Th17、Treg)、培养时间 阅读提示:Materials and methods - Cell culture |
| IDH2机制研究 | 质粒构建(Flag-PRMT1、His-IDH2、突变体)、转染方法、Co-IP条件、交联反应(戊二醛浓度)、体外甲基化实验条件、IDH2活性检测方法 阅读提示:Materials and methods - Co-IP, Transfection, IDH2 activity assessment |