SARS-CoV-2在免疫功能低下儿童中的持续性存在

SARS-CoV-2 persistence in immunocompromised children

作者信息Susan A Dolan, Jean Mulcahy Levy, Angela Moss, Kelly Pearce, Molly Butler, Sarah Jung, Samuel R Dominguez, Eric Mwangi, Kelly Maloney, Suchitra Rao
PMID34453477
发布时间2021-12
DOI10.1002/pbc.29277

实验完整度

中

回顾性队列研究,包括描述性统计、Kaplan-Meier分析和CT值检测,但无功能性验证或机制研究。

主要模型

免疫功能低下儿童队列 肿瘤儿童患者 免疫抑制治疗儿童患者

重点核对

纳入标准:在儿童医院Colorado检测出SARS-CoV-2阳性且免疫功能低下 主要结局:两次连续阴性PCR检测的时间(至少间隔24小时) 重复检测:全血细胞计数,包括ANC和ALC,在首次阳性后72小时内 CT值检测:使用CDC 2019-nCoV RT-PCR诊断试剂盒对亚组连续样本进行复检

摘要

目标:我们评估了免疫功能低下儿童(ICC)SARS-CoV-2阳性的持续时间,确定了与病毒持续存在相关的因素,并测定了病毒持续存在儿童的循环阈值(CT)值作为病毒载量的替代指标。方法:我们对2020年3月至2021年3月在一家儿科医院就诊的ICC进行了回顾性队列研究。免疫功能低下状态定义为原发性、继发性或由于医学合并症/免疫抑制治疗而获得。主要结局是两次间隔至少24小时的连续阴性SARS-CoV-2聚合酶链反应(PCR)检测中的第一次的时间。使用疾病控制中心(CDC)2019-nCoV实时逆转录酶(RT)-PCR诊断试剂盒对同一受试者的连续临床标本进行检测。采用描述性统计、Kaplan-Meier曲线中位事件时间和log-rank检验比较组间结局。结果:91名儿童符合纳入标准。中位年龄为15.5岁(四分位距[IQR] 8-18),64%为男性,58%为白人,43%为西班牙裔/拉丁裔。大多数(67%)在门诊进行检测,58%无症状。两次阴性检测的中位时间为42天(IQR 25.0-55.0),按疾病表现或免疫抑制程度分组的中位时间无差异。7名儿童有不止一份样本可重复检测,其中5/7(71%)的初始CT值<30(中高病毒载量);4名儿童在3-4周后CT值<30,提示中高病毒载量持续存在。结论:大多数SARS-CoV-2感染的ICC病情较轻,但病毒持续存在超过6周,且病毒载量为中高。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
免疫功能低下儿童SARS-CoV-2病毒持续存在的时间及相关因素是什么?
核心机制
病毒持续存在与免疫抑制程度相关,肿瘤儿童中位时间更长,但差异未达统计学显著。
主要证据
91名儿童队列,中位时间42天;7名儿童亚组CT值分析显示多数初始CT<30,部分3-4周后仍CT<30。
研究意义
研究表明ICC病毒持续存在时间较长,即使无症状也可能具有传染性,支持基于PCR检测的隔离策略。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

队列建立与数据收集

确定免疫功能低下儿童SARS-CoV-2感染持续时间的基线特征

从电子健康记录中回顾性收集2020年3月19日至2021年3月28日期间在儿童医院Colorado检测的儿童数据,筛选出91名符合条件的ICC,并提取人口学、临床和实验室数据。

2

病毒持久性评估

评估ICC SARS-CoV-2感染持续的时间

主要结局为两次连续阴性PCR检测的时间,使用Kaplan-Meier曲线描述中位时间,并通过log-rank检验比较不同组间差异。

3

CT值分析

评估病毒持续存在儿童的病毒载量作为潜在传染性的替代指标

对7名有连续样本的儿童使用CDC试剂盒复检,计算平均CT值,并随时间绘制。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
CDC 2019-nCoV实时RT-PCR诊断试剂盒----
Abbott RealTime SARS-CoV-2检测Abbott Laboratories--
Simplexa COVID-19 Direct检测DiaSorin Molecular LLC--
BioFire呼吸道面板2.1BioFire Diagnostics--
Xpert Xpress SARS-CoV-2/Flu/RSV检测Cepheid--

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
队列纳入
免疫抑制定义:原发性、继发性或获得性;包含癌症、移植后、免疫抑制药物等
阅读提示:Methods 2.3 Participants
病毒检测
检测平台:CDC、Abbott、Simplexa、BioFire、Xpert;CT值计算:N1和N2基因靶标的平均CT值
阅读提示:Methods 2.4 Testing
结局定义
主要结局:两次连续阴性PCR的时间,间隔≥24小时;第二次阴性在首次阳性后21天
阅读提示:Methods 2.6 Outcomes
统计方法
Kaplan-Meier分析分层:肿瘤分类、症状状态、ALC分类
阅读提示:Methods 2.7 Statistical methods