抗原选择与序列保守性分析
确定用于通用疫苗的保守流感病毒抗原。
对H1N1亚型及1组HA/NA的流感病毒蛋白序列进行比对,分析HA茎部、NA、M2和NP的保守性。
A Multi-Targeting, Nucleoside-Modified mRNA Influenza Virus Vaccine Provides Broad Protection in Mice
包含体外蛋白表达验证、小鼠免疫与攻毒保护实验、抗体功能分析(中和、ADCC)、被动转移实验及T细胞反应检测等多个独立证据层级,且包含功能与机制验证。
雌性BALB/c小鼠(6-8周龄) NIH/3T3细胞 MDCK细胞 HEK293T细胞
疫苗剂量:单次皮内免疫20 μg/抗原(主要实验)或10 μg/抗原(被动转移实验) 攻毒剂量:5×、50×或500×LD50的H1N1pdm(IVR-180)或其他病毒株 攻毒途径:鼻内接种50 μL病毒 观察终点:14天内监测体重变化和死亡率 对照组:荧光素酶(Luc)mRNA-LNP作为阴性对照,QIV作为标准护理对照
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定用于通用疫苗的保守流感病毒抗原。
对H1N1亚型及1组HA/NA的流感病毒蛋白序列进行比对,分析HA茎部、NA、M2和NP的保守性。
确认编码抗原的mRNA在细胞中正确表达。
构建编码Mini HA、NA、M2和NP的mRNA,转染NIH/3T3细胞,通过Western blot和流式细胞术验证蛋白表达。
评估疫苗诱导的体液免疫反应。
小鼠单次皮内免疫mRNA-LNP疫苗,28天后采集血清,通过ELISA检测抗原特异性抗体、中和试验和ADCC报告试验评估抗体功能。
评估疫苗对致死性病毒攻击的保护效果。
免疫后28天,用不同剂量(5×、50×、500×LD50)的H1N1pdm或多种1组流感病毒进行鼻内攻毒,监测14天体重和存活率。
确定保护作用主要由抗体还是细胞介导。
小鼠接受两次免疫(间隔4周),收集血清和脾细胞,分别通过腹腔和静脉转移至naive小鼠,然后攻毒。
评估疫苗诱导的细胞免疫反应。
免疫后12天,分离脾细胞,用NA或NP肽库刺激,通过流式细胞术检测CD4+和CD8+ T细胞的细胞因子产生。
确定疫苗的最低有效剂量。
小鼠免疫不同剂量(5、0.5、0.05、0.005 μg)的NA或联合疫苗,28天后攻毒,评估保护效果。
评估疫苗对1组流感病毒的交叉保护。
小鼠单次免疫20 μg mRNA-LNP,28天后用多种1组病毒(NC99、PR8、H5N8、cH6/1N5)攻毒,监测保护效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 病毒培养 | 鸡胚 | Charles River Laboratories | -- |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | HyClone | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Corning Life Sciences | -- | |
| HEPES | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | 聚乙烯亚胺 | -- | -- |
| 蛋白纯化 | 镍氮基三乙酸琼脂糖 | QIAGEN | -- |
| 蛋白检测 | 抗HIS抗体 | Abcam | -- |
| mRNA体外转录 | T7 RNA聚合酶 | Ambion | -- |
| mRNA修饰 | 1-甲基假尿苷三磷酸 | TriLink | -- |
| mRNA加帽 | CleanCap帽类似物 | TriLink | -- |
| mRNA转染和表达验证 | 抗NP小鼠单克隆抗体 | Bio X Cell | BE0159 |
| 流式细胞术 | FITC偶联二抗 | Cayman Chemical | -- |
| Cytofix/Cytoperm固定破膜试剂 | BD Biosciences | -- | |
| Perm/Wash缓冲液 | BD Biosciences | -- | |
| LIVE/DEAD可固定aqua死细胞染色试剂盒 | Life Technologies | -- | |
| 抗CD4 PerCP/Cy5.5抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD8 Pacific Blue抗体 | BioLegend | -- | |
| 抗CD3 APC-Cy7抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗TNF-α PE-Cy7抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗IFN-γ Alexa Fluor 700抗体 | BD Biosciences | -- | |
| 抗IL-2 Brilliant Violet 711抗体 | BioLegend | -- | |
| 细胞刺激 | 抗CD28抗体 | BD Biosciences | -- |
| GolgiPlug(布雷菲德菌素A) | BD Biosciences | -- | |
| GolgiStop(莫能菌素) | BD Biosciences | -- | |
| 佛波醇12-肉豆蔻酸酯13-乙酸酯 | -- | -- | |
| 离子霉素 | Sigma | -- | |
| ELISA | Immulon 4 HBX 96孔板 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP | Abcam | -- | |
| SigmaFast OPD底物 | Sigma | -- | |
| 盐酸 | Fisher Scientific | -- | |
| Synergy H1混合多功能酶标仪 | BioTek | -- | |
| 细胞ELISA | 多聚赖氨酸 | Sigma | -- |
| TransIT-LT1转染试剂 | Mirus | -- | |
| 被动转移 | ACK裂解缓冲液 | Gibco | -- |
| 70微米过滤器 | Falcon | -- | |
| 微量中和试验 | 受体破坏酶 | Seiken | -- |
| 柠檬酸钠 | Fisher Scientific | -- | |
| TPCK处理的胰蛋白酶 | -- | -- | |
| Ultra-MDCK培养基 | Lonza | -- | |
| 鸡红细胞 | Lampire | -- | |
| ADCC报告试验 | ADCC效应细胞(表达小鼠FcγRIV的Jurkat细胞) | Promega | -- |
| Bio-Glo荧光素酶底物 | Promega | -- | |
| 超低IgG胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 统计软件 | Prism软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 疫苗免疫 | 小鼠品系(BALB/c)、年龄(6-8周)、性别(雌性)、免疫剂量(20 μg/抗原)、免疫途径(皮内)、注射体积(100 μL)、注射位点(背部两处) 阅读提示:Materials and Methods - mRNA Vaccination and Virus Challenge |
| 攻毒实验 | 攻毒病毒株(IVR-180等)、攻毒剂量(5×、50×或500×LD50)、攻毒途径(鼻内)、攻毒体积(50 μL)、监测时间(14天)、体重下降终点(25%) 阅读提示:Materials and Methods - mRNA Vaccination and Virus Challenge;Results - 相应攻毒结果部分 |
| ELISA检测 | 包被抗原浓度(重组蛋白2 μg/mL或纯化病毒5 μg/mL)、血清稀释系列(3倍)、二抗稀释度(1:15,000)、底物反应时间(10分钟)、读板波长(490 nm) 阅读提示:Materials and Methods - ELISAs |
| 微量中和试验 | MDCK细胞密度(2.5×10^4/孔)、病毒量(100 TCID50)、血清RDE处理条件、孵育时间(1小时)、感染时间(72小时)、温度(33°C) 阅读提示:Materials and Methods - Microneutralization Assay |
| ADCC报告试验 | MDCK细胞密度(2.5×10^4/孔)、病毒感染复数(MOI 5)、血清起始稀释度(1:25)、效应细胞数(7.5×10^4/孔)、孵育时间(6小时) 阅读提示:Materials and Methods - Antibody-Dependent Cell-Mediated Cytotoxicity Reporter Assay |
| T细胞反应分析 | 免疫后时间(12天)、脾细胞数(3×10^6/样本)、肽库浓度(5 μg/mL/肽)、刺激时间(6小时)、GolgiPlug/GolgiStop加入时间(1小时后)、流式抗体组合 阅读提示:Materials and Methods - Staining and Flow Cytometry Analyses |