ASO设计和体外验证
设计靶向Ube3a-AS的ASO并确认其降解RNA的能力
设计20mer gapmer ASO,并验证其与Ube3a-AS结合后诱导RNase H降解。
Prenatal delivery of a therapeutic antisense oligonucleotide achieves broad biodistribution in the brain and ameliorates Angelman syndrome phenotype in mice
包含体外报告模型(Ube3a-YFP)和疾病模型(AS小鼠)的体内实验,涵盖生物分布、分子功能和行为表型验证。
Ube3a-YFP报告小鼠 Ube3a母源缺陷(AS)小鼠模型
ASO在E13.5-E14.5通过IC或IA注射的剂量 IC注射剂量1 μg和2.5 μg IA注射剂量20 μg 行为测试包括加速旋转杆和恐惧条件化
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
设计靶向Ube3a-AS的ASO并确认其降解RNA的能力
设计20mer gapmer ASO,并验证其与Ube3a-AS结合后诱导RNase H降解。
确定ASO是否能在体内激活父源Ube3a表达
通过IC注射ASO至Ube3a-YFP小鼠,检测YFP表达和Ube3a-AS水平。
评估ASO是否能够恢复UBE3A功能并改善行为表型
对AS小鼠进行IC注射ASO,进行行为测试和免疫荧光分析。
探索IA注射是否能有效递送ASO至大脑并发挥作用
对Ube3a-YFP小鼠进行IA注射ASO,分析生物分布和UBE3A表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| ASO设计和合成 | Ube3a-AS反义寡核苷酸 | IDT | -- |
| 对照处理 | 乱序反义寡核苷酸 | IDT | -- |
| 手术操作 | 异氟烷 | -- | -- |
| 灌流和固定 | 磷酸盐缓冲液 | -- | -- |
| 免疫荧光 | 抗NeuN AF555抗体 | Millipore | MAB377A5MI |
| 抗GFP抗体 | Abcam | ab13970 | |
| 山羊抗鸡AF594抗体 | Thermo Fisher | ab150176 | |
| DAPI封片剂 | Invitrogen | 00-4959-52 | |
| qRT-PCR | Ube3a-AS的TaqMan检测试剂 | -- | Mm03455899_m1 |
| RNeasy RNA提取试剂盒 | Qiagen | 74134 | |
| TurboDNA去除试剂盒 | Invitrogen | AM1907 | |
| AffinityScript QPCR cDNA合成试剂盒 | Neta Scientific | 600559 | |
| TaqMan通用PCR预混液 | Applied Biosciences | 4304437 | |
| 行为测试 | 加速旋转杆 | -- | -- |
| FreezeScan冻结行为分析系统 | Cleversys, Inc | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | Ube3a-YFP小鼠(JAX 017765)和Ube3a+/−小鼠(JAX 16590)的繁殖方案,具体为WT雌性×Ube3a+/YFP雄性,以及WT雄性×Ube3a+/−雌性,以产生半合子后代 阅读提示:Materials and methods, Animals |
| ASO设计 | ASO序列、LNA修饰和硫代磷酸酯骨架,以及靶向序列的具体位置(chr7:66602939-66602958, mm9) 阅读提示:Materials and methods, ASO design |
| 给药方式与剂量 | IC注射时,E13.5-E14.5,剂量为1 μg或2.5 μg,注射体积2.5 μL;IA注射时,剂量20 μg,注射体积2.5 μL 阅读提示:Materials and methods, In utero administration of ASO |
| 生物分布分析 | miRNAscope ISH的固定、切片和染色条件,包括热诱导表位修复时间(88°C 10分钟或95°C 15分钟)和酶处理时间(40°C 15分钟) 阅读提示:Materials and methods, miRNA ISH assay |
| 行为测试 | 行为测试的顺序和时间(旋转杆、埋珠、旷场、新物体识别、恐惧条件化),恐惧条件化参数(70 dB、2 kHz音调,0.6 mA电击) 阅读提示:Materials and methods, Behavioral testing |