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技术贴二:如何选择适合你的成像系统 :信噪比
人阅读 发布时间:2019-12-05 13:51
信噪比(SIGNAL-NOISE RATIO,简称:SNR)是一个经常被提及的概念,也是成像系统的一个重要指标,它指的是信号与噪声的比值。今天让我们一起来深入理解信噪比。
信号Signal
我们先来说信号:在化学发光实验中,信号是指样品的自发光,而光子数就是光强度的定量表述。在上一期技术贴的分享中,我们就提到相机所能捕捉到的信号强度与其量子效率(QE)成正比:相机量子效率越高,灵敏度也越高,所能采集到的信号就越强。(点击这里回顾上期内容)。
为了加强信号,除了选择高灵敏度的相机,还可以:1. 增强样品信号(比如:我们做化学发光的时候可以选择信号更强的发光液);2. 延长曝光时间(如下图所示)(图一:同一样品采用不同的曝光时间)
在同一个显示范围下,延长曝光时间,可以增加相机所获取的信号强度。
成像过程中的三种噪声,接下来,让我们了解一下在成像过程中不可避免的三种“噪声”,他们会对成像结果产生影响。
1、散粒噪声(Photo shot noise) 由于光信号的量子特性,入射到芯片的光子变成电子时的不确定性被称之为散粒噪声。他和信号的关系如下:
散粒噪声是一种物理现象,它不能通过相机的设计来减少,因此在比对相机信噪比的时候,我们主要考虑的是另两种噪声:读出噪声和暗电流噪声。
2、读出噪声(Read noise)
读出噪声是相机在读出信号时产生的噪声,是电子通过前置放大器和模-数转换器(ADC)转换为数字信号时所产生的噪声(如图二所示)。低的读出噪声有利于检测非常微弱的信号,使其不至于被淹没在读出噪声中。
(图二:读出噪声的产生)
举个例子,上海勤翔化学发光成像系统相机的读出噪声在 3e-5e 左右,即每转换一次数字信号,会产生的噪声为3到5个电子数。
3、暗电流(Dark current)
相机传感器内部的硅晶格产热所产生的电子被称为暗电流。由于这些电子也会被像素采集,所以暗电流也成为了一种噪声。因为暗电流是随时间累积的,它的单位以每个像素每秒产生的的电子(e-/p/s)表示。这就意味着在长时间曝光的应用中,暗电流影响相对较大,是一个需要着重考虑的因素。
因为暗电流是热效应导致的,所以制冷是降低暗电流的主要措施。制冷相机最常用的制冷方法是热电冷却,又称珀尔帖冷却 (Peltier cooling),即由和传感器相连的散热器进行散热。如图三所示,降低CCD温度可以减少噪点。(图三:降低CCD温度,减少背景噪点)
但是,暗电流并非随着温度的降低而线性下降。如图四所示:在接近-23℃时,暗电流的下降趋于平缓并接近水平。因此,很多品牌的化学发光成像系统采用绝对温度-25℃的制冷相机。上海勤翔所采用的制冷相机,其绝对温度可达-30℃以下,并且在绝对温度-20℃时就可以将暗电流降至最低 0.0001e/Pixel/Second。
(图四:制冷温度和暗电流)
值得注意的是:制冷温度并不是制冷CCD相机的重要指标之一,因为制冷仅仅是降低暗电流的手段之一,所以暗电流大小才是关键性指标。
举个例子
如上表所示,F 相机尽管可以达到绝对温度-40℃,但是它的暗电流在极限情况下为0.0005e/p/sec。P相机绝对温度最低可降至-30℃以下,但是在零下20℃时产生的暗电流仅为F相机的1/5,说明P相机在整体设计上可以更合理地减少暗电流。此外,制冷温度过低,也会影响相机的寿命,尤其当相机的生产工艺不能达到完全真空密封时,低的制冷温度可能造成相机雾化和内部积水的情况,造成相机的损坏。
噪声的公式成像所产生的噪声为以上三种噪声的标准差,用公式可表示为:
噪比SNR
学习了信号以及噪声后,我们便可以推导出信号的信噪比公式:
由于散粒噪声无法避免,对比相机信噪比主要考虑读出噪声和暗电流噪声,因此,信噪比公式也可以简化为:
总结一下,今天我们一起学习了信噪比,它作为成像系统的一个重要指标与以下几点有关:
1. 信号强度
在相机本身的量子效率不变的前提下,我们可通过增强样品信号或延长曝光时间来收集更多信号,即光子。信号越强,信噪比越好。
2. 散粒噪声
噪声本身也是一种信号,而散粒噪声作为无法避免但影响最大的噪声,伴随着信号的加强而增大,然而信噪比仍然会随着信号的增强而增大。
3. 暗电流噪声
尽管延长曝光时间可以增强信号,但是暗电流噪声却随着曝光时间的增加而增强。在需要长时间曝光的应用中,我们常用制冷的方式来降低暗电流。由于制冷只是降低暗电流的手段之一,所以制冷的温度事实上不能作为制冷CCD相机的参数之一。
4. 读出噪声
低的读出噪声有利于检测非常微弱的信号,使其不至于被淹没在读出噪声中。
举个例子 上海勤翔化学发光成像系统所采用的制冷CCD相机,读出噪声为3-5e,暗电流最低可达0.0001e/p/sec,即使曝光时间长达30min,其产生的暗电流最低为(0.0001e*1800sec)=0.18e,远低于信号本身,可在长时间曝光的应用下保证信噪比,从而满足化学发光成像系统的需要。