从“提取”到“直扩”的协同路径——广州湾区生物动/植物直扩PCR方案(DPTI-50/200;DPPL-25/50)
159 人阅读发布时间:2025-08-27 16:58
核酸提取决定了下游PCR/测序的效率与可靠性。传统提取技术在高纯度核酸获取(如测序、克隆构建、长期保存)中不可替代;而直扩(Direct PCR)在快速检测、高通量筛查、现场应用中展现出效率与通量优势。广州湾区生物推出动物组织直扩PCR试剂盒(DPTI-50/200)与植物组织直扩PCR试剂盒(DPPL-25/50),在复杂组织抑制物耐受、流程时效、批量一致性方面表现优异。
传统提取的不可替代性:当目标是高纯度核酸(二代测序、构建、长期存储/二次分析)时,离心柱/磁珠等传统路线仍是金标准。
直扩的独特价值:当目标是快速判定、批量筛查、应急响应或现场检测时,直扩以“裂解即扩增”的路径显著降低了时间/操作成本/设备门槛。
直扩不是“省略步骤”的粗暴简化,而是体系化减少抑制物和提高下游PCR mix 抑制物耐受性优化的工程:
湾区体系思路:通过缓冲体系、螯合与屏蔽机制、减少抑制物,优化湾区生物直扩PCR mix的抑制物耐受性,实现样本裂解液在优化的PCR mix中稳定地扩增。
3. 数据概览
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灵敏度与稳定性:在鼠肝、鼠肉、鼠尾、鼠爪等样本中,湾区直扩体系获得稳定PCR结果,并在重复性上表现稳健。
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复杂背景耐受:在脂质/蛋白含量较高样本中仍能稳定扩增,阴阳判定清晰。
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通量优势:省去纯化环节,使批量上样/快速轮转成为可能。
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广谱兼容性:覆盖水稻、玉米、番茄、黄瓜等多作物体系,跨物种稳定扩增。
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田间样本友好:具备较好耐受,适合田间直采直扩的快检路径。
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通量优势:省去纯化环节,使批量上样/快速轮转成为可能
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科研/育种高通量筛查:基因分型、突变体筛选、转基因鉴定等,直扩显著缩短周期;对“阳性命中”的关键样本再行传统提取用于下游深度分析。
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动检/农检/食安现场应用:应急响应、田间快检、初筛环节,用直扩提升速度与覆盖;确证环节再走传统提取。
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自动化/数字化实验室:直扩更易与微量化、板式化、机器人上样协同,降低人工变异。
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样本处理:动物组织尽量去脂;植物组织取嫩叶/新鲜组织优先,可减少抑制。
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裂解步骤:按试剂盒说明的温度与时间执行;裂解后短暂离心去除碎屑更利于一致性。
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上样体积:遵循推荐用量;当样本抑制疑虑较大时,先小体积探索,必要时做2×以上稀释验证。
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PCR设定:遵循推荐的循环参数与退火温度;多靶标项目建议加入内标以判断抑制风险。
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直扩适用于快速检测与高通量筛查,当目标是高纯度核酸或深度下游应用(如NGS、基因克隆构建)时,建议采用传统提取。
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不同物种/组织类型的抑制谱不同,建议用户在新物种上线前以阳性/阴性/抑制对照完成快速适配测试。
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若遇到临界阳性样本,建议复检或转传统提取验证,确保结果稳健可复核。