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承启高精度蛋白质组质谱解决方案惊艳亮相第四届炎症与肿瘤-蛋白质组学(国际)研讨会

人阅读 发布时间:2019-12-05 14:46

作为中国人类蛋白质组组织(CNHUPO)、国际人类蛋白质组组织(HUPO)的标志性学术活动之一的炎症与肿瘤-蛋白质组学(国际)研讨会,于11月23日在暨南大学曾宪梓科学馆国际会议厅隆重召开,承启生物也受邀参与了本次组学国际会议,与到场约400名专家学者一同探讨当下蛋白质组学的先进研究。

 

 • 大会专家合影

 

 

 “不同于往日”的蛋白质组学会议

本次大会以“肿瘤精准治疗与蛋白质组学大数据与人类健康”为主题,邀请了17名国内外知名科学家做专题报告。但对比上一届(第三届)会议几乎所有演讲者的演讲题目中都有“蛋白质组”字样的盛况,今年的报告则更多是对某一蛋白质或通路的深入研究。

 

例如,天津医科大学药学院的孔德新教授讲述了靶向PI3K/AKT信号通路的抑制剂以用于癌症治疗,来自D.E.Shaw Research的单一兵教授做了题为《A comprehensive structural model of Ras-Raf signalosome》报告,从结构和构象动力学的角度来研究Ras-Raf 生物分子的功能和调控的分子机制。这样“不同于往日”的蛋白质组学会议似乎带给人们一丝疑惑:蛋白质组学的发展是否遇到了某些阻力?

 

• 天津医科大学孔德新教授做报告

 

 

蛋白质组的精准性问题

蛋白质组学的困境源于质谱的精准性问题。质谱是当前蛋白质组研究的主流技术,但看着那边测序已经如火如荼地在进行多方临床应用的尝试,这边的蛋白质组质谱离临床还有很长一段距离。

 

质谱的低重现性(一般只能达到65-85%)、不稳定性困扰科学界已久。Science曾组织专题研讨会讨论如何提高质谱的重现性,指出现有质谱的重现性远远不能满足生物标志物(biomarker)的要求。 

 

人们寄希望于更高端的质谱仪,在当下只能选择“将错就错”。但如此不准确的重现性无疑将浪费大量科研资源,甚至造成不可靠的结论,也使得基于质谱的生物标志物的发现及临床应用无法快速发展。

 

实际上,这样的问题在测序上也同样存在,并且是行业内广泛存在的严重问题。“组学技术不精准,精准医学就不可能精准”。开发高稳健性、高准确度的组学技术方案,成为精准医学迫在眉睫的基础性问题。

 

 

自主技术让质谱精准起来

对此,承启生物陈洋博士在大会上分享了承启生物的突破性解决方案。

 

早在2018年,国家重点研发计划《医学生命组学数据质量控制关键技术研发与应用》(坊间称为“组学国标”)项目便将承启生物高精度、高稳健的全国产、全自主检测全流程作为蓝本,使得承启生物在业内迅速走红(相关链接:牛!组学国标项目尘埃落定,竟是以一家公司的流程为蓝本!)。承启生物技术团队带着自主研发的多项技术,参与了“组学国标”项目的相关研究,在多方联合攻关下,项目很快便硕果累累,不仅在测序上做到了目前世界最高精度,蛋白质组质谱方面同样屡次刷新世界纪录。

 

• 承启生物陈洋博士做报告

 

在使用基于“数据非依赖性采集”(DIA)的HRM-MS方案,对大肠杆菌全蛋白质组进行质谱测定的研究中,项目组于今年4月份发表的论文中已经能够稳稳做到高达99.8%的质谱重现性!在单次蛋白质组质谱实验中,可鉴定细菌体内99%的蛋白质,鉴定人细胞内93%的蛋白质。重现性及蛋白质鉴定数量双双刷新了世界纪录。

 

随后,在今年7月,为法国客户所做的样品重现性更是高达99.5-99.9%,鉴定量再次刷新项目组自己刚创造不久的记录,说明这一技术已经成熟,可用于商业化运作。

 

误差极小、重现性极高的全流程组学技术将在科研领域掀起新的浪潮,解决许多以往难以解决的生物学问题。例如暨南大学、德国夏洛特医科大学的研究者们便是借着该技术,用极致的精度揭示了细菌操纵子的调控规律。

 

极高的重复性将开启基础科研落地临床应用的加速通道,树立行业标杆,中国将率先建立起质控标准体系,蛋白质组质谱技术将走向标准化、规范化。

 

• 大会现场

 

大会在新理念、新思维的碰撞、交流中圆满结束。专家们对蛋白质组学在炎症与肿瘤方面的研究,提出了新颖独到的见解和富有价值的策略,这些都将极大地推动领域的发展,共同为人类健康出谋划策。

 

承启生物也将紧跟生命科学的发展步伐,持续推动基因测序行业革新,用自主创新的技术不断为健康中国的实现贡献力量!


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