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常见问题 Q&A

发布时间:2017-01-19 16:17 |  点击次数:


HLA-B*5801HLA-B*1502不能算是SNP,概念类似于多个SNP组合。
1.HLA 基因是一段高度变异的基因:两个人之间平均的基因差异约为0.1-0.4%,但若单看HLA ClassⅠ基因的话,则可能高达8.6%(Genome Res.2000 Oct; 10(10): 1597-86)
2.就因为这段基因如此复杂,所以依照血清型或基因型有两套命名规则。而HLA-B*5801HLA-B*1502就是依照特定的基因序列所命名出来的。
3.HLA allele nameSNP的关系可以入下图表示:

Am J Hum Genet.2008 Jan 10: 82(1):48-56
HLA 基因上的确有非常多的SNP,而不同的allele,操应可视为由SNP排列组合而成。



可进入世基官网(http://www.pharmigene.com.tw)填入需求,会有专人与客户联系,提供产品最新产品说明书相关信息。


4run之内,我们保证48 rxn kit可做20个样本


世基检测试剂盒应保存于
-20。当使用时,应置于冰上解冻,并避免光线直射。因试剂中含有对温度敏感之酵素,建议不要冷冻解冻超过三次,若每次操作之检体量不多,建议将分装Mastermix PCT,以稳定数据结果。


PCT为带有HLA-B*1502/Internal Control Gene (管家基因Housekeeping gene) 或带有HLA-B*5801/Internal Control Gene (管家基因Housekeeping gene)的质粒 DNA


阴性
(空白)对照组加水,是为了确认试剂配制操作的过程中,没有受到污染。当空白控制组出现Ct值时,表示人为污染出现在本次操作中,通常有可能是来自检体的基因体DNA污染,或是来自阳性控制组的核酸分子的污染。
的样本

PG5801或是PG1502gDNA样本型别,为使用内部控制基因(Internal Control)的值跟Genotype gene之间的ΔCt值来确定。Internal ControlCt<27的判定条件,可确保样本质量及试剂的效能状况,不需要特别带一个已知的阴性样本,来确定试剂效能能够分出一个已知的阴性样本。




因为肝素Heparin会抑制PCR反应。我们建议您使用含有柠檬酸钠Sodium Citrate(蓝头管)EDTA(紫头管)为抗凝剂的采血管。 




我们建议您使用已通过世基公司质量检测之Qiagen QIAamp® DNA Blood Mini Kit来萃取血液中的基因体DNA




为了维持良好的反应结果,我们建议DNAOD260/280比例为1.72.0之间。




产品说明书上写明每个反应内含25~100 ng gDNA,意即浓度最好落于12.5~50 ng/μl之间。有些实验室会使用buffy coat提取gDNA,浓度会比较高,但最好不要超过100 ng/μl,不足或过量的gDNA可能会造成内部控制组的Ct值过高的风险。