细胞STR鉴定，常见问题答疑

　　1.报告结果中提示的多等位基因结果是什么？

　　答：正常的人源细胞组织细胞其STR图谱，一个基因位点仅出现一个或2个峰。如发生细胞交叉污染现象，基因位点会出现多等位基因，即一个基因位点出现3个或以上峰。考虑到微卫星的不稳定，也不排除细胞突变的情况。

　　2.细胞匹配的判读标准是什么，怎么通过结果大致分析是否存在交叉污染？

　　答：参考ATCC-ANSI细胞鉴定标准，检测细胞和官方数据比对，匹配度低于0.8则判定细胞和目标细胞系不匹配。匹配度在0.8-1.0之间，判定细胞基本匹配，可能存在交叉污染或者传代代次过高导致的细胞质量下滑，位点突变的情况。

　　需注意，当出现3个及以上多等位基因结果时，需进一步参考数据库排查是否存在叉污染。匹配度为1.0则样本和目标细胞完全匹配，且细胞质量较好。

　　3.目前小鼠细胞的STR鉴定是否可以做？

　　答：目前除部分公布的小鼠细胞位点数据外，还采取自行收录标准样本的方式整合小鼠细胞数据库，市面上常见的小鼠细胞系结果均可进行鉴定。部分少见细胞系，需要通过定向数据比对的方式来确定来源。

　　4.什么是STR？细胞系鉴定原理简单描述？STR检测结果里边的数字是什么意思？

　　答：STR:基因上的短串联重复序列分子标记（ATATATATATATAT，数字代表段串联序列重复次数）。每一株构建的细胞系都有一组特异性的STR数据与之对应，细胞系是否正确，检测该样本的STR与数据库对应的细胞系STR比对是否一致即可。一旦细胞系的遗传特性被确立，细胞系就应该定期的检测，以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。

　　5.什么时候需细胞系鉴定？

　　1、发表文章或申请课题经费前；

　　2、使用细胞进行临床治疗（试验）前；

　　3、准备冻存保种或已冻存多年的细胞；

　　4、一个涉及到细胞试验项目开始/结束时；

　　5、新得到的细胞或实验室培养5代以上的细胞；

　　6、细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大；细胞功能不正常；

　　7，实验室新建立的细胞系；

　　6，所鉴定的细胞系数据库没有STR数据参考怎么办？为什么会无匹配？原代细胞能够做细胞鉴定吗?

　　答：出现匹配不上任何已知数据情况，是因为这株细胞的标准序列并没有收录在国际的细胞库之中，导致送检样本与任何的序列都不匹，或者样本是自主构建的新细胞系。没有对比数据的，按说也要检测一下STR，只要做出来str数据跟数据库排查，如果最后无匹配结果，问题不大，如果跟其他细胞匹配上比如跟hela匹配上就有问题。原代细胞亦可做细胞系STR鉴定，一方面将其STR与数据库做个排查。原代细胞鉴定需客户提供原始组织和原代细胞，成组检测，以原始组织的STR分型结果作为标准数据进行比对。

　　7.细胞鉴定的官方数据来源？

　　答：DSMZ数据库，是整合4个国际权威数据库：美国ATCC、德国DSMZ、日本JCRB和RIKEN，Expasy数据库辅助判断。

　　8.细胞鉴定STR体系涵盖多少个位点？

　　答：国际金标准8个STR和1个性别鉴定位点，更额外赠送12个STR位点辅助判断。

　　9.细胞鉴定STR体系是否能应用于干细胞存储领域？

　　答：细胞鉴定是一种司法亲子鉴定技术，不仅可以鉴定商品化的细胞株，还能应用于干细胞来源性辅助鉴定。入库细胞和对应干细胞存储者来源是否一致，也可通过细胞鉴定来实现。

　　10.细胞鉴定STR能否分辨转染细胞株的成功率和挑选转染细胞株？

　　答：目前测试下来，转染和基因改造的细胞系，STR结果基本一致，匹配度大概在0.9-1.0之间，仅通过STR的方法还是没办法做筛选稳转株的目的，建议是通过WB和基金测序，单克隆挑选来筛选想要的稳转细胞株。