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证据证据证据!外泌体circUHRF1抑制自然杀伤细胞功能

发布时间:2020-09-03 08:47 |  点击次数:

        自然杀伤细胞(NK)在天然抗肿瘤免疫反应中发挥重要作用。近年来,NK细胞功能障碍在包括肝癌在内的多种恶性肿瘤中得到证实。然而,NK细胞功能障碍在人HCC中的分子生物学机制尚不清楚。本文部分回答了该问题:HCC来源的外泌体通过诱导NK细胞上TIM-3的表达抑制IFN-γTNFα的产生。本文于2020年6月27日发表在《Molecular cancer》期刊上。
技术路线:

主要结果:
1、HCC组织中UHRF1相关circRNA的分析
        UHRF1通常在HCC进展中上调表达,此外,circRNA是pre-mRNAs的反向剪切产物且通常被认为是癌细胞中pre-mRNAs剪切的副产物。一般来说,circRNAs的水平通常与各自的mRNA水平一致,因此,作者检测了UHRF1来源的14种circRNA的表达水平(Fig.1A),其中hsa_circ_0048677 (circUHRF1)的表达最丰富且在HCC中显著上调(Fig.1B)。进一步地,作者发现circUHRF1的表达在癌中显著高于癌旁组织,且circUHRF1高表达的病人具有更大的肿瘤体积,血液中NK细胞含量更低,更多的微血管入侵以及更差的预后(Fig.1C-I)。

图1 circUHRF1在HCC组织中上调表达
2、HCC细胞以外泌体方式分泌circUHRF1

        前人的研究表明可以通过外泌体在细胞间运输,因此,作者猜测circUHRF1可能被HCC细胞转运至其它细胞,为了验证这个猜想,作者从HCC细胞系上清中分离鉴定到外泌体(Fig.A-B)。结果发现circUHRF1在六种HCC细胞系和对应的外泌体中的表达趋势一致,且HCCLM3和SMMC-7721细胞系及其外泌体中的表达显著高于其它细胞系(Fig.C-D)。此外,检测发现circUHRF1存在与血浆中,并且HCC病人中血浆外泌体circUHRF1显著高于健康志愿者,接受肿瘤切除术的病人外泌体circUHRF1含量降低,肿瘤逃逸的病人外泌体circUHRF1含量升高,这些结果说明血浆外泌体circUHRF1主要有HCC细胞产生(Fig.E)。有趣的是,有免疫逃避机制的患者血浆外泌体circUHRF1水平显著升高,外周血NK细胞比例降低(Fig.F)。这表明血浆外泌体circUHRF1可以作为NK细胞相关免疫逃逸的关键分子决定因素。

图2 circUHRF1的表达及特性
3、HCC细胞抑制NK细胞功能通过外泌体circUHRF1

        为了确定HCC细胞的外泌体circUHRF1是否诱导改变异种NK细胞,作者将6个健康供体的NK细胞和HCCLM3和SMMC-7721细胞系以对等比例共培养24小时,结果发现,与单独培养NK细胞相比,共培养后细胞IFN-γ和TNFα的分泌显著受损(Fig.3A-C)。此外,NK细胞和HCCLM3和SMMC-7721细胞系共培养后显著增加了circUHRF1表达,但是这种增加被外泌体抑制剂GW4869抑制(Fig.3D-E)。不仅如此,加入外泌体抑制剂后NK细胞中IFN-γ和TNFα的分泌在是否与HCC细胞共培养的组间没有表现出差异(Fig.3F-G)。此外,circUHRF1沉默后HCCLM3和SMMC-7721细胞外泌体中circUHRF1的表达显著下降,而IFN-γ和TNFα的分泌显著升高(Fig.3H-J)。上述结果表明HCC来源的外泌体circUHRF1损伤NK细胞的功能。

图3 外泌体表达circUHRF1抑制NK细胞的功能
4、在NK细胞中,circUHRF1和miR-449c-5p相互降解

        作者进一步探究circUHRF1在NK-92细胞中可以结合miRNA,通过StarBase v3.0分析,预测到14个潜在的靶miRNAs。使用circUHRF1特异性和NC探针进行体内circUHRF1沉淀,然后检测circUHRF1复合物中14个靶miRNAs的表达。实验发现,复合物中显著富集miR-449c-5p,而其它则少有富集(Fig.4A)。然后,在NK-92细胞中使用anti-AGO2抗体进行RIP实验,结果发现circUHRF1和miR-449c-5p在anti-AGO2抗体中显著富集,这些结果表明circUHRF1可能是miR-449c-5p和AGO2的结合平台(Fig.4B)。为了进一步验证这个结果,进行了生物素标记的miR-449c-5p的pulldown实验,结果表明与NC相比,circUHRF1显著富集(Fig.4C)。荧光素酶实验结果显示,与NC相比,miR-449c-5p显著降低了野生型circUHRF1的荧光素酶活性,但对突变型的没有影响(Fig.4D-E)。有趣的是,circUHRF1的表达水平可以被过表达miR-449c-5p显著抑制,反过来,miR-449c-5p的表达也可以被过表达circUHRF1显著抑制(Fig.4F-G)。这些结果表明circUHRF1和miR-449c-5p相互靶向结合。

图4 circUHRF1抑制miR-449c-5p在NK细胞中的生物学功能
5、circUHRF1上调TIM-3的表达通过抑制miR-449c-5p活性

        通过上述实验结果,作者猜测circUHRF1可能通过miR-449c-5p海绵上调其靶点的水平进而增强HCC病人的免疫逃逸。为了验证这个猜想,作者首先分析了NK细胞中miR-449c-5p靶点的表达水平,包括TIM,然后使用荧光素酶实验进一步验证miR-449c-5p与TIM的结合(Fig.5A-B)。强制表达miR-449c-5p后,TIM的表达显著下降(Fig.5C-D)。此外,circUHRF1的表达与miR-449c-5p的表达负相关,与TIM的表达呈正相关,miR-449c-5p的表达也与TIM的表达呈负相关(Fig.5E-G)。以上研究结果表明circUHRF1/miR-449c5p/TIM-3轴联合作用影响NK细胞的功能。


图5 在NK细胞中,circUHFR1调控miR-449c-5p/ TIM-3通路
6、circUHFR1以NK细胞依赖的方式诱导HCC的进展

        慢病毒载体pLO5-ciRcircUHRF1显著提高了细胞和外泌体中circUHFR1的表达,以及NOD/SCID小鼠模型体内的肺转移结节(Fig.6A-C)。此外,过表达circUHFR1具有肺转移的小鼠体内血浆外泌体circUHFR1的含量显著升高,而NKG2D阳性细胞数量显著下降(Fig.6D-E)。这些结果表明circUHFR1以依赖外泌体和NK细胞的方式促进HCC进展。

图6 circUHRF1以NK细胞依赖的方式诱导免疫逃逸
7、circUHRF1增强HCC对抗PD1治疗的耐药性

        鉴于强制表达circUHRF1抑制NK细胞的功能,所以接下来作者评估过表达circUHRF1是否会进一步阻碍anti-PD1的抗肿瘤作用。作者回顾性分析了30例在免疫治疗前2-36个月行肝切除术并接受抗PD1免疫治疗的复发远处转移(包括肺转移)的HCC患者的资料。6个治疗周期后,评估CT疗效。结果发现3个病人表现部分响应(PR),7个病人表现稳定疾病(SD),20个病人表现进行性疾病。进一步研究发现circUHRF1的表达水平在PD组显著高于SD组和PR组,而NKG2D阳性细胞数量在PD组显著低于SD组和PR组,两者呈现负相关性(Fig. 7A-C)。
        为了进一步评估circUHRF1对anti-PD1治疗耐药的影响,建立了皮下植入circUHRF1敲低的HCCLM3细胞或阴性对照细胞的异种移植模型。结果表明注射circUHRF1敲低的HCCLM3细胞导致小鼠对anti-PD1治疗敏感且总体生存率升高(Fig. 7D-F)。这些结果表明强制表达circUHRF1可能妨碍HCC对anti-PD1治疗的响应,靶向circUHRF1可能是恢复HCC对anti-PD1治疗敏感性的有效方法。

图7 在HCC患者中,高水平的circUHRF1与anti-PD1治疗的耐药性相关

        总之,本文证明HCC来源的外泌体通过诱导NK细胞上TIM-3的表达抑制IFN-γ和TNFα的产生。还报道了肿瘤外泌体通过外泌体circUHRF1抑制NK细胞功能的新机制,为HCC细胞和NK细胞的相互干扰提供了新的证据。
参考文献:

Zhang Peng-Fei., Gao Chao., Huang Xiao-Yong., Lu Jia-Cheng., Guo Xiao-Jun., Shi Guo-Ming., Cai Jia-Bin., Ke Ai-Wu.(2020). Cancer cell-derived exosomal circUHRF1 induces natural killer cell exhaustion and may cause resistance to anti-PD1 therapy in hepatocellular carcinoma. Mol. Cancer, 19(1), 110. doi:10.1186/s12943-020-01222-5