扩增子测序
16S/18S/ITS 等扩增子测序
扩增子测序主要通过对特定长度的 PCR 产物进行测序分析，针对环境样本，16S/18S/ITS 等基因扩增子测序是研究环境微生物多样性及群落组成差异的重要技术手段之一。
根据不同的研究目的和需求，天益提供 4 种扩增子产品：16SrDNA 测序、18SrDNA 测序、ITS 测序及功能基因区域测序。具体介绍如下：
16SrDNA 测序
16SrDNA 为编码原核生物核糖体小亚基 rRNA 的 DNA 序列，具有 10 个保守区域和 9 个高变区域 (图 1，V1-V9)，其中保守区在细菌间差异不大，高变区具有属或种的特异性，对 16SrDNA 某个高变区进行测序，用于研究环境微生物中细菌或古菌的群落结构多样性。
18SrDNA 测序
18SrDNA 为编码真核生物核糖体小亚基 rRNA 的 DNA 序列。对 18SrDNA 某个高变区进行测序，用于研究环境样本中真核微生物群落结构多样性。
ITSrDNA 测序
ITS 分为两个区域：ITS1 和 ITS2，ITS1 位于真核生物 rDNA 序列 18S 和 5.8S 之间，ITS2 位于真核生物 rDNA 序列 5.8S 和 28S 之间。对 ITS1 或 ITS2 进行测序，用于研究环境微生物中真菌群落结构多样性。
生物信息分析
1. 原始数据整理、过滤及质量评估
2. OTU 生成和注释
3. 基于物种丰度分析：
稀释曲线
丰度分布曲线
Alpha 多样性分析
物种丰度差异分析
4. 基于群落结构分析：
单样品物种分布饼图
多样品物种分布柱图
含进化关系的物种丰度
Beta 多样性分析
5. 根据客户需求进行个性化分析