​肺癌基因甲基化的临床检测意义

   2019-03-15
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在肿瘤细胞中存在多种不同类型的基因被甲基化,提示多途径参不了肿瘤的发生。对肺癌相关甲基化 DNA 检测可辅助肿瘤的诊断以及评估治疗反应和预后情况。透景选用 SHOX2  和 RASSF1A  两个基因作为甲基化检测的组合,可有效实现对肺癌的早期辅助诊断。

一、SHOX2  基因

矮小同源盒基因 SHOX2(Short Stature Homobox2,SHOX2) 是同源盒基因家族的一员,   位于 3 号染色体长臂(3q25-q26.1), 约 10kbp,分为 SHOX2a(3152bp)、SHOX2b(3224bp)、SHOX2c(3116bp)三个亚型。主要功 能在于脊椎动物的胚胎形成的转录调节 [14,15]。研究发现,SHOX2  基因在多种实体肿瘤中表达异常,如肺癌,乳腺癌和肾癌。Dietrich [16] 等人于 2010  年首次发现  SHOX2   甲基化能较好的区分肺部良恶性病发,灵敏度和特异度分别为 68% (95%CI:62-73%)和 95%(95%CI:91-97%)。他们继续将 SHOX2 甲基化在肺癌患者的血液 [17] 和组织 [18] 中深入研究,结果显示甲基化的 SHOX2 不仅可以作为早期检测的生物指标,而且 SHOX2 甲基化可以作为非小细胞肺癌预后的独立预测指标 [19]。

二、RASSF1A  基因

2000  年,Dammann  等 [20] 利用酵母双杂交筛选方法在这一最小纯合缺失区中兊隆出一个不鼠的 Ras  效应蛋白 Norel  和 Maxpl  高度同源的 cDNA,将其命名为 Ras  相关区域家族 l(Ras-association domain family 1,RASSFl) 基因,幵发现该基因由于外显子的选择性剪接和启动子的不同存在着不同的转录本 (transcript),其中最普遍且最重要的是转录本 A,即 RASSFlA。RASSFl 基因位于染色体 3p21.3。Ras 相关区域家族 lA(Ras-association domain family 1A,RASSFlA) 基因调控的靶基因涉及基因转录、信号转导、细胞骨架、细胞周期、细胞黏附及凋亡等多方面,作为一种新型肿瘤抑制基因,在肿瘤发生及发展过程中的作用尤为重要,目前认为,RASSFlA  基因表达失活主要不启动子区异常的高甲基化、杂合性缺失及染色体缺失有关。Dammann  等 [21] 在近期的肺癌相关基因研究中也发现了 71% 的 NSCLC  细胞株和 44% 的原发肺癌中存在 RASSFlA 的甲基化,而在正常肺组织中却没有出现该基因的甲基化。Ito  等 [22] 在对 138 例 NSCLC  的研究中也发现了 32% 的肿瘤中存在 RASSFlA  的甲基化,而且该基因的甲基化不患者的年龄、性别以及肿瘤的组织类型、分化程度和病理分型无明显相关性。此外,Shimizu  等 [23] 也证实了 RASSFlA 的表达缺失不肺腺癌的发生密切相关。Tomizawa  等 [24] 还提出,在 NSCLC  中,RASSFlA  在腺癌中的甲基化频率比在鳞状细胞癌中更高。

SHOX2 和 RASSF1A 基因甲基化检测的组合,主要可用于肺部良恶性鉴别诊断及辅助肺癌早期筛查:

1.  肺部病发良恶性鉴别诊断:支气管灌洗液进行细胞学检查无法确定为肺癌的患者,进行 SHOX2、RASSF1A 基因甲基化检测,可进一步提高肺癌检出率和特异性。

2.  肺癌早期筛查:肺癌患者血浆中约 62% 可检测到 SHOX2、RASSF1A 基因甲基化,而在非肺癌对照组只有 6% 发现 SHOX2 基因甲基化,甲基化定量处于较低水平。

编辑: zhuq    来源:丁香园

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