网络式大数据构建“药物Google搜索工具”揭示药物与疾病之间联系
讲座摘要:
美国国立卫生研究院NIH资助建立网络集成式细胞内特征的公共数据(LINCS)项目,旨在开发细胞水平上药物特性的生物学标签,通过监视细胞内表型的变化动态反映药物作用机制,使我们能迅速了解个体细胞的药物功能基因组学和药物代谢组学的特征。LINCS项目开发Connectivity Map(Cmap)数据库,收集了使用化合物处理和相关基因干扰剂处理的人类细胞基因表达的信息像是一本药物基因表达的目录,利用高通量、低成本的检测方案搜索Cmap数据库将基因、疾病及药物作一个连结,进而揭秘中草药、天然活性成分及小分子化合物的作用机制,发展新药开发或老药新用达到个体化医疗的目的。
另外,LINCS项目在线网络分析平台也为全球的科研人员提供个体化代谢组学的数据库,旨在开发单细胞水平的药物特性的代谢图谱,利用高内涵检测技术可得到固定细胞中蛋白的免疫检测,活细胞凋亡图像分析,蛋白激酶生化分析以及细胞活力相关的生理参数,为研究者和临床诊断医生探测单细胞个体分析和如何用药提供了一个独特的工具。
应用美国NIH LINCS大数据项目可获得新药开发整合式解决方案,加速常规的药物研发周期、降低研发成本、多参数系统性揭示药物治疗疾病的新机制。