利用单分子分辨技术研究基于成像的人类单细胞转录组学
摘要:
荧光原位杂交(FISH)技术被广泛应用于单细胞的转录拷贝数统计和亚细胞定位。然而目前的技术手段并不能很容易的分析全转录组的数据。本文中我们将分支DNA技术和自动化流体处理技术,高通量成像技术以及定量成像分析技术结合在一起,使我们能以单分子成像对数千单细胞的转录数据进行高度可重复性的定量。除此之外,我们还可对量化后的亚细胞形态,转录本空间特性和不同细胞间可变性得到全景掌握。这为基因表达水平上细胞间的可变性提供了多个解释,同时也能使我们在避免干扰转录组原有特征的情况下对其进行功能相关性鉴定。因为这种方法可以和一系列高效成像技术相结合,我们认为它有广泛的应用前景。
Nat Methods. 2013 Nov;10(11):1127-33. doi: 10.1038/nmeth.2657. Epub 2013 Oct 6.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Image-based+transcriptomics+in+thousands+of+single+human+cells+at+single-molecule+resolution.