GCBI:基因数据指导精准医疗

乳腺癌耐药性研究

   2015-11-11
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PMID: 21422418    影响因子:17.879    GEO样本数:120

脱离文献,挖掘数据

  首先,怎么找到这篇论文呢?比方说,我们对乳腺癌感兴趣,可以输入“乳腺癌”,你没看错,可以输入中文,即可得到相关文献列表,使用两侧的筛选器挑选含有样本、文献类型等的文献。

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我们可以使用文献中的样本,也可以直接搜索样本。文献和样本选择好之后,可将样本发送到GCBI在线实验室进行数据分析。
其中精彩节选:

质控结果:详见视频 51 分 34 秒

差异基因结果:详见视频 00:55:08

表达趋势结果,详见视频 01:58:40

Signal-net 结果,详见视频 01:03:20

基因共表达网络结果,详见 01:03:52 信号通路间互作关系:详见 01:20:33

火山图、聚类图,详见视频 01:23:50
数据结果展示如下:

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本次课程中,老师设计了四个方案,我们分别来看。

临床分期差异性基因群的特征

按照区域淋巴结转移的分期特点做了四个分组,来筛选关键基因,能不能构建共表达网络,有哪些基因有共同表达趋势以及趋势基因之间的作用关系。

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pCR 不同的调控机制

疗效不同的最直接指标— pCR (病理完全缓解)差别背后的调控机制是什么?

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HER2+ 对 pCR 影响的机制

这个方案探讨了 HER2+ 情况下 pCR 差异的信号调节关系。

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原发肿瘤特征的梯度差别

通过设置原发肿瘤大小的不同,来探讨是否有特定基因群调节。

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详细内容请点击视频:http://college.gcbi.com.cn/silu/653.jhtml

GCBI 学院每周四晚8点在线直播肿瘤基因大数据挖掘的课程,提供相关课题设计思路、研究思路,生物信息学分析方法介绍、精彩文章解读以及数据重新挖掘等内容,不断提升生物医学科研人员在基因研究领域的技能。

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编辑: wuch    来源:丁香园

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