乳腺癌耐药性研究
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PMID: 21422418 影响因子:17.879 GEO样本数:120
脱离文献,挖掘数据
首先,怎么找到这篇论文呢?比方说,我们对乳腺癌感兴趣,可以输入“乳腺癌”,你没看错,可以输入中文,即可得到相关文献列表,使用两侧的筛选器挑选含有样本、文献类型等的文献。
我们可以使用文献中的样本,也可以直接搜索样本。文献和样本选择好之后,可将样本发送到GCBI在线实验室进行数据分析。
其中精彩节选:
质控结果:详见视频 51 分 34 秒
差异基因结果:详见视频 00:55:08
表达趋势结果,详见视频 01:58:40
Signal-net 结果,详见视频 01:03:20
基因共表达网络结果,详见 01:03:52 信号通路间互作关系:详见 01:20:33
火山图、聚类图,详见视频 01:23:50
数据结果展示如下:
本次课程中,老师设计了四个方案,我们分别来看。
临床分期差异性基因群的特征
按照区域淋巴结转移的分期特点做了四个分组,来筛选关键基因,能不能构建共表达网络,有哪些基因有共同表达趋势以及趋势基因之间的作用关系。
pCR 不同的调控机制
疗效不同的最直接指标— pCR (病理完全缓解)差别背后的调控机制是什么?
HER2+ 对 pCR 影响的机制
这个方案探讨了 HER2+ 情况下 pCR 差异的信号调节关系。
原发肿瘤特征的梯度差别
通过设置原发肿瘤大小的不同,来探讨是否有特定基因群调节。
详细内容请点击视频:http://college.gcbi.com.cn/silu/653.jhtml
GCBI 学院每周四晚8点在线直播肿瘤基因大数据挖掘的课程,提供相关课题设计思路、研究思路,生物信息学分析方法介绍、精彩文章解读以及数据重新挖掘等内容,不断提升生物医学科研人员在基因研究领域的技能。
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