CNV检测—疾病基因组DNA研究重装上阵

CNV检测技术

   2014-08-23
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鉴于CNV 在研究人类疾病发生机制方面的重要意义,对人类基因组CNV 变异情况的研究引起了越来越多的关注和重视。目前测定CNV的方法主要包括芯片技术、高通量测序、PCR技术,FISH等。每种测定方法都有各自的特点(见表1.CNV常用检测方法比较),其中芯片检测方法最为突出,我们将对主要的检测方法进行介绍。

表1.CNV常用检测方法比较

 

核型分析

荧光原位杂交(FISH

二代测序

基因芯片

分辨率

检测范围

只能检测大于5-10Mb突变

只能检测已知位点,通量较小

覆盖全基因组

覆盖全基因组

杂合性缺失(LOH/单亲二倍型(UPD

不能检测

不能检测

能检测

能检测

针对FFPE样本

FFPE 失败率高

FFPE失败率高

FFPE样本运行测序困难

有专门针对存放时间较长的FFPE样本的芯片产品

优缺点

染色体处理过程对操作者技术要求高,不同人员操作可能会导致完全不同的展带效果

定制进口探针,价格昂贵

成本昂贵

一张芯片,多种数据,快速、准确、高性价比

 

 

编辑: gaowei2010    来源:丁香园