分选那些事｜效率，回收率，得率，傻傻分不清楚！

在日常流式细胞分选实验中，我们经常会对分选细胞质量，分选系统性能进行评估；通常使用到最多的评估指标就包括：纯度，效率，回收率，得率，活率。我们如何理解这些指标？我们对「效率，回收率，得率」名词非常熟悉，但总是傻傻分不清楚！

» 什么叫纯度，效率，回收率，得率，活率？

1. 分选后所得到的细胞是否全都是想要的细胞？（纯度）
2. 仪器显示分选的细胞数量占样品中目的细胞数量的百分比？（效率）
3. 实际分选得到细胞数量占仪器显示分选细胞数量的百分比？（回收率）
4. 从样品目的细胞中实际分选得到了多少目的细胞？（得率）
5. 分选后得到的细胞是否全都是活细胞？（活率）

» 如何计算纯度，效率，回收率，得率，活率？ 

» 举个例子：

假设分选门 A 门显示有 10000 个细胞（target cells in original sample），
仪器显示分选到管中有 9000 个细胞（target cells sorted as indicated e instrument），
那么效率为 90% = 9000/10000 × 100%；
在分选管中加入 PI，回测分选管所有细胞显示总细胞数 8000 个，其中 A 门有 6000 个，PI 阴性门有 7200 个，
那么纯度为 75% = 6000/8000 × 100%；
活性率为 90% = 7200/8000 × 100%；
回收率为 66.7% = 6000/9000 × 100%；
得率为 60% = 6000/10000 × 100%。

由此可见，经常在流式软件上看到的分选效率并不等于分选得率！如果要计算分选得率，需要上机回测分选管中目标细胞的数量。因此，分选效率可以在分选过程中由软件实时计算结果；而分选得率必须在分选实验结束后上机回测才能计算结果。

参考文献：

Rmax: A systematic approach to evaluate instrument sort performance using center stream catch. Methods 82 (2015) 64–73.

图片来源：索尼生物

编辑： z翟某某    来源：丁香园