一种快速确定流式单细胞孔板分选效率的方法

   2019-10-31
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流式细胞分选仪为分离单个细胞用于培养或下游分子应用(如 PCR,基因表达,单细胞 mRNA 测序等)提供了机会。其中一些分子研究成本很高,例如单细胞测序,以至于常常需要一种可靠的方法帮助研究者确认流式细胞分选仪分选的单个液滴能够准确进入 96 孔板或者 384 孔板。由于这些孔板能够实现十分微小的反应体系,减少了试剂的用量,从而能够减少实验成本。然而,一些分选细胞在孔板中的缺失会造成重复检测,检测成本增加。

为了验证分选效率,常用的显微镜观察方式非常费时费力,本文介绍了一种快速、可靠且成本低的显色方法,这种方法基于 ELISA 显色反应原理,分选样本中的辣根过氧化物酶(HRP)与收集仓孔板中的 3,3',5,5'-四甲基联苯胺(TMB)接触后,TMB 被氧化迅速变为蓝色,通过颜色变化可以直观判断分选效率。

▊ 材料和方法

试剂:
1.TMB (BioLegend PN421501) 4 ℃ 避光保存;
2.HRP (Life Technologies PN31490) -20 ℃ 保存;3.1×PBS;

仪器:Sony SH800S 智能全自动流式细胞分选仪

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创新微流体芯片液流系统
全自动化校准,免除人为调试
样本全部流路均易于更换
1 分钟插拔式更换,可实现样本之间零交叉残留
可配备多达 4 根激光 (405/488/561/638)
覆盖所有常见荧光染料
3 种规格芯片 (70 μm/100 μm/130 μm)
充分满足研究者对不同大小细胞的分选需求
单细胞分选及索引分选功能
便于对目标单个细胞追踪溯源

步骤:

1. 96 孔板每孔加入 2 μl TMB,或者 384 孔板每孔加入 1 μl TMB,体积取决于实验需要用到的孔板类型,也可依据正式的实验体系灵活放大;

2.  制备细胞样本(最好使用正式实验将用到的细胞样本),参考流程如下;
a)  把 500 µl 细胞悬液加到 1.5 ml EP 管里;
b) 500×g 离心 4 分钟;
c)  移去上清,500 μl 1×PBS 重悬;
d) 500×g 离心 4 分钟;
e)  移去上清,375 µl 1×PBS 重悬;
f)  把 125 µl HRP 加到细胞重悬液中,终浓度为 250 µg/ml。

3. 校准并设置 Sony SH800S 流式细胞分选仪。通过 Sorting Test 各分选 20 个液滴到板盖 4 角的孔上,检查是否对准孔正中心位置,如果没有对准,做必要的孔板位置调整;

4. 分选细胞到提前准备的含有 TMB 的孔板中,每孔 1 个细胞;

5. 分选完成后立即离心孔板,以确保分到的液滴与孔中的 TMB 溶液混合;

6. 5-10 分钟后计数孔板中颜色变蓝的孔的个数并统计百分比,正常状态下效率应当超过 90%;此外,颜色深浅与分选到孔中的细胞数量成正相关。

▊  结果显示

良好
96 孔板分选效率>95% 

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384 孔板分选效率>95%

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较差 
96 孔板分选效率<30%

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▊  结论

本文成功展示了一种简单方法,能够帮助实验者在预实验时快速确认单细胞孔板分选的效率,避免浪费样本和检测试剂,确保实验成功机率。

该方法能够非常灵敏的检测单个液滴,既可以在无需任何其他设备情况下,直观的获取颜色变化结果;也能够借助酶标仪对显色反应进行液滴定量。

▊  参考来源

1. 牛津大学基因组中心;

2. A Rapid Method to Verify Single-Cell Deposition Setup for Cell Sorters.OliviaRoosRodrigues,1 Simon Monard2* Cytometry Part A 89A: 594600, 2016

图片来源:索尼生物

编辑: z翟某某    来源:丁香园

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