DNA pull down 概述
DNA pull down 概述
DNA pull down是用于分析蛋白质与DNA互作的一种分析技术。一般来说,该实验首先,需要针对待研究目的基因的调控区域设计并制备特异性探针(以脱硫生物素标记为主流);同时,制备细胞核提取物;将探针和核提取物共同孵育,DNA结合蛋白就会和靶向序列特异性结合;然后,通过亲和素磁珠纯化蛋白质DNA复合物;最后针对获得的蛋白,使用western blot验证或者质谱方式鉴定蛋白质类型。
优点:
① 富集分析低丰度蛋白;
② 探针制备简便,周期短;
③ 获得特异性蛋白与下游蛋白质检测技术兼容;
缺点:
① 长连探针往往存在非特异结合现象;
② 反应条件要求无核酸酶;
③ 体外实验,相对体内实验存在一定弊端;