免疫组库测序技术分析策略
分析流程：
1、测序数据下机后，首先对下机数据进行质控。
2、参考序列的构建：采用IMGT数据库中所有V/D/J germline序列与特异性的引物比对。
3、将下机数据paired end reads拼接成一整条contig，merged后的contig即是测到的受体的重组基因序列。
4、使用对比程序将clean data与IMGT免疫细胞受体库的V\D\J基因比对，搜索相应的基因片段。
5、为确保结果的高准确度，在完成初步比对后，将比对序列再次与数据库做重比对，以寻找精确的V\D\J基因片段和序列的位点。
6、在比对分析鉴定出测序数据对应的基因片段后，即可分析测序数据的序列结构特征。由于华大的流程中使用了重比对的方法，对比结果的准确性较高，因此，碱基插入缺失的检出率也更加准确。
免疫组库测序信息分析内容：
1、基本数据统计
1）数据过滤，对原始数据进行去除接头污染序列及低质量reads的处理
2）数据搭建，数据拼接，消除测序背景及有效数据构建
3）数据统计，数据产出统计及测序数据的成分和质量评估
2、数据比对分析
1）比对分析，与数据库（IMGT）V/D/J基因片段比对
2）重新比对，寻找最佳V/D/J比对结果
3）比对结果分析，与数据库（IMGT）比对去掉无效序列（未比对、假基因、终止子、无开放阅读框）和Primer
3、序列结构分析
1）分析CDR序列组成及序列碱基成分
2）分析CDR序列的碱基插入和缺失
3）编码CDR序列翻译成氨基酸和肽链
4、免疫组库构建
1）构建免疫组库表达谱，统计多样性抗体库克隆表达情况
2）免疫组库多样性呈现，绘制V/J基因表达的2D、3D图
信息分析内容正在升级中，敬请期待!我们也可结合客户的需求，协商定制化信息分析内容。