非靶向代谢组学服务
一、服务介绍
非靶向代谢组学也称为发现型代谢组学,适用于没有预期研究目标时选用。其特点是尽可能的定性出更多代谢物,覆盖更多的代谢通路。我们采用高通量GC-TOFMS平台(Pegasus HT, Leco)和自主研发的代谢组学数据处理系统为客户提供全自动、高通量、一站式的非靶向代谢组学服务。使用该平台,代谢组学检测所涉及到的样本制备、数据信息提取、代谢通道分析和统计报告全部可全自动化运行。基于我们自建的包含1500+小分子代谢物的质谱库JiaLibTM,该平台能够准确、快速地分析各种生物样本(血、尿、组织、唾液、羊水、细胞和细胞液等)及植物样本中上覆盖95%以上pathway的小分子代谢物,反映生命体对外界刺激、病理生理变化、以及本身基因突变而产生的体内代谢物水平的多元动态反应,为疾病诊断、病理研究、新药开发、药物毒理学等研究提供新的探索视角。
二、技术亮点
1. GC-TOF/MS平台拥有国际最大的内源性功能小分子代谢物标准品库,经十多年的积累,采购了1500余种小分子化合物标准品,构建了基于不同生物基质的代谢质谱库JiaLib™,该数据库包含两套不同保留指数体系(Alkanes和FAMEs),适用不同色谱条件下保留时间拟合;UPLC-Q-TOF/MS平台正负离子模式下拥有10万+二级质谱库;
2. 检测生物样本种类齐全:血(血浆、血清、全血、血片、红细胞膜等)、尿液、组织(肝、肠、脑、肺、皮肤、脂肪等)、肠内容物、粪便、唾液、精液、卵泡、乳汁、羊水、外泌体、细胞和培养液、胎盘、微生物、植物样本等;
3. 全自动前处理:GC-TOF/MS平台采用德国Gerstel领先工业自动化技术,实现在线衍生和样本分析协同进行,UPLC-Q-TOF/MS平台采用Beckman自动移液工作站,避免人为操作误差,每台仪器年样本处理量超过1.5万例;
4. 全自动数据处理:采用自主研发的iMAP软件,提供数据预处理、代谢物鉴定、统计分析、代谢通路分析、中英文数据报告等一站式解决方案;
5. 严格的QA/QC体系,保证每个项目的真实性和可靠性。
三、工作流程
四、应用领域:
五、 样本量推荐:
血:150 µL
尿:150 µL
组织:150 mg
新鲜粪便:150 mg
冻干粪便:25 mg
细胞:5-10E6
六、样本数要求:
细胞/微生物样本每组至少6个生物学重复;
模式动物/植物样本每组至少10个生物学重复;
临床样本一般每组至少50个生物学重复(严格控制患者入组条件)。
七、 样本运输:
干冰运输,按5公斤/天准备
八、客户应用案例:
客户案例 | lnc-Dpf3抑制CCR7介导的树突状细胞迁移 (Immunity,IF=21.52)
客户案例 | 运动产生的α-KG通过OXGR1刺激肌肉肥厚和脂肪分解(EMBO Journal,IF=11.23)
客户案例 | PDK3和HSF1形成正反馈回路驱动癌细胞耐药 (Theranostics,IF=8.06)
客户案例 | CircHMGCS1通过调节IGF信号通路和谷氨酰胺分解促进肝母细胞瘤细胞增殖(Theranostics,IF=8.06)
客户案例|抑制泛素化修饰改变线粒体形态并重新编程癌细胞的能量代谢 (JCI Insight, IF=6.01)
客户案例 | 肺癌中果糖代谢通路的促癌新机制 (JCI Insight, IF=6.01)
九、被引用文献
1) Yunping Qiu, Guoxiang Cai, et al. A Distinct Metabolic Signature of Human Colorectal Cancer with Prognostic Potential. Clin Cancer Res, 2014, 20(8): 2136-46. (IF=8.738, Citations:16) http://clincancerres.aacrjournals.org/content/20/8/2136.long
2) Jinglei Yang, Tianlu Chen, et al. Potential Metabolite Markers of Schizophrenia. Mol Psychiatry, 2013, 18(1): 67-78. (IF=13.3, Citations: 59) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3526727/
3) Guoxiang Xie, Tianlu Chen, et al. Urine Metabolite Profiling Offers Potential Early Diagnosis of Oral Cancer. Metabolomics, 2012, 8(2): 220-31. (IF=3.7, Citations: 26)
4) Ying Qi, Pin Li, et al. Urinary metabolite markers of Precocious Puberty. Mol Cell Proteomics, 2012, 11(1): 91-113. (IF=5.9, Citations: 23) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3270102
5) Jie Wei, Guoxiang Xie, et al. Salivary Metabolite Signatures of Oral Cancer and Leukoplakia. Int. J. Cancer, 2011, 129(9): 2207–217. (IF=5.5, Citations: 72) https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/ijc.2588
6) Tianlu Chen, Guoxian Xie, et al. Serum and urine metabolite profiling reveals potential biomarkers of human hepatocellular carcinoma. Mol Cell Proteomics, 2011, 10(7): 3060-75. (IF=5.9, Citations: 145) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3134066
7) Wei Sha, Kerry-Annet Da Costa, et al. Metabolomic Profiling Can Predict Which Humans Will Develop Liver Dysfunction When Deprived of Dietary Choline. FASEB J, 2010, 24(8): 2962-75. (IF=5.3, Citations: 96) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/pmid/20371621/
十、公司资质
Tel:400-867-2686
Email : marketing@metaboprofile.com