纯合的Apoe突变小鼠表现了标志性的不受年龄和性别影响的总血浆胆固醇水平的增高。最接近主动脉的肥胖特征在三月龄时被发现。这种损伤随着年龄增长,并且进入少脂质但是多伸长的细胞的损伤,更加先进阶段的动脉粥样症前损伤的典型。适度增长的甘油三酸酯的水平在这种混合的C57BL/6 x 129遗传背景突变小鼠上已经被报告。年老的APOE缺陷小鼠(>17月龄)被用于研发脑部的大部分由结晶质的胆固醇裂口、脂质小球和泡沫细胞组成的黄瘤损伤。更小的黄瘤在脉络膜丛和腹部的穹中被看到。最近的研究表明APOE缺陷小鼠已经改变对压力、被损伤的立体空间学习和激励的应答,改变长的期限作用增强,和染色体接合的伤害。