如何用 MEGA 构建进化树?
今天教大家如何用 MEGA 构建进化树!一、序列比对常见算法:Muscle、ClustalW1、打开 MEGA 软件,这里以 7.0 版为例,依次按照箭头方向进行选择2、序列比对经以上步骤后弹出新的对话框:M7:Alignment Explorer若没有显示我们的目标 fasta 文件,请注意修改这里的文件后缀名称3、打开后的 species.fasta 文件注意:重点来啦!4、然后呢?然后就比对好了,查看一下首位是否比对齐,没有比齐的碱基就删除掉5、最后,将比 ...
来源:小张聊科研 85074 阅读
如何使用 DNAMAN 软件制作序列比对图 (发表论文用)
DNAMAN 是美国 Lynnon Biosoft 公司开发的高度集成化的分子生物学综合应用软件,可以用于多序列比对、PCR 引物设计、限制性酶切分析、质粒绘图、蛋白质分析等,几乎囊括了所有日常核酸、蛋白质序列的分析工作。因此掌握它,是从事分子生物学工作的必备。本文系丁香园站友gxumxc整理,若有不当之处,敬请指出。图1图2图3图4图5图6图7图8图9图10图11原帖链接:http://www.dxy.cn/bbs/topic/1205 ...
来源:互联网 66639 阅读
两分钟教你学会 Oligo 7
在专门的引物设计软件中,“Oligo”是最著名的。它的使用并不十分复杂,但初学者容易被其复杂的图表吓倒。Oligo 5.0的初始界面是两个图:Tm图和ΔG图;Oligo 6.0的界面更复杂,出现三个图,加了个Frq图。“Oligo”的功能比“Premier”还要单一,就是引物设计。但它的引物分析功能如此强大以至于 能风靡全世界。oligo的下载和安装我就不多说了,打开oligo相信也无需多讲。打开oligo的页面如下:单击file ...
来源:丁香园 50403 阅读
25羟基维生素D,你检测了吗?
25羟基维生素D,你检测了吗?一、维生素D简介维生素D为类固醇衍生物,属脂溶性维生素。维生素D主要由人体皮肤经紫外线照射后合成,少部分从食物或补充品中摄入。现已知对人体较为重要的是维生素D2和维生素D3。研究表明,维生素D不仅仅影响钙磷代谢,而且具有广泛的生理作用,是维持人体健康、细胞生长和发育的必不可少的物质,与多种疾病密切相关。二、维生素D的生理功能:1.调节体内钙磷代谢,维持血磷和血钙浓度;2.促进生长和骨骼钙 ...
来源:科瑞美 44324 阅读